「彼は一日に何度も手を洗う習慣がある」
→「He is in the habit of washing his hands many times a day.」
「彼は」「一日に何度も」「手を洗う」「習慣がある」
「~する習慣がある」は「be in the habit of ~ing」で表します。
「used to ~」は「以前〜をしていた」という意味で、「昔は〜だったけど今は違う」というニュアンスを含みます。
「~につき」という表現は「a(an) ~」や「per ~」を使います。 「a(an) ~」はカジュアルな表現で日常ではこちらを使い、「per ~」はフォーマルな表現となります。 「a(an) ~」は冠詞なので「単数名詞」でしか使えませんが、「per ~」は前置詞として使えます。
「彼は一日に何度も手を洗う習慣がある」は「He is in the habit of washing his hands many times a day.」
となります。