「あれが彼女が会いたがっている少年ですか？」
→「Is that the boy she wants to meet?」
「あれが」「彼女が会いたがっている少年」「ですか？」
「あれが」・・・・・・・・・・・主語(S)
「彼女が会いたがっている少年」・補語(C)
「ですか？」・・・・・・・・・・述語(V)
「彼女は少年に会いたがっている」→「she wants to meet the boy」
関係代名詞「whom」を使い「少年＝the boy」を説明する文にすると
「彼女が会いたがっている少年」→「the boy whom she wants to meet」
となります。ここで目的格の「whom」は省略することができるので
「the boy she wants to meet」とすることができます。
「文型」：第２文型(SVC)
「S」：that
「V」：is ~
「C」：the boy she wants to meet
「あれが彼女が会いたがっている少年ですか？」は「Is that the boy she wants to meet?」
となります。